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Trabalhos do Programa de Pós-Graduação em Bioinformática

Data de defesa Título Aluno Orientador Nível
19/03/2021 Simulation of Biochemical Systems Using Constraint-Based Methods and Complex Networks Paulo Eduardo Pinto Burke Luciano da Fontoura Costa Doutorado
19/03/2021 Transcriptômica de autismo e deficiências intelectuais: uma abordagem de biologia de sistemas para identificar especificidades e convergências Bruna Garbes Gonçalves Pinto Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
19/01/2021 Composição microbiana de inóculo e do composto maduro no processo de compostagem do Zoológico de São Paulo avaliada por meio de metagenômica Suzana Eiko Sato Guima João Carlos Setubal Mestrado
09/11/2020 Identificação por phage display de candidatos vacinais para esquistossomose mansônica baseada na auto-cura de macacos rhesus (<i>Macaca mulatta</i>) João Vicente de Morais Malvezzi Sergio Verjovski de Almeida Mestrado
28/09/2020 Imunologia do Câncer de Melanoma Cutâneo: Uma Abordagem de Biologia de Sistemas Mindy Stephania de Los Angeles Muñoz Miranda Helder Takashi Imoto Nakaya Doutorado Direto
08/09/2020 Comparação de redes de regulação genica da placenta em resposta a exposição ao estresse entre sexos  André Rocha Barbosa Helena Paula Brentani Doutorado
19/08/2020 Análise e reconhecimento da forma tripomastigota de Trypanosoma cruzi para parasitemia automatizada em imagens com baixa densidade de pontos Diogo Matos da Silva Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
29/05/2020 Analise integrada de alterações somáticas e transcricionais em tumores de pâncreas Diogo Vieira da Silva Pellegrina Eduardo Moraes Rego Reis Doutorado
31/03/2020 Detecção de populações em dados de sequenciamento de RNA de células individuais por meio de módulos de coexpressão Tiago Lubiana Alves Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
23/03/2020 Identificação e anotação de RNAs longos não-codificantes em Schistosoma mansoni e Schistosoma japonicum  Lucas Ferreira Maciel Sergio Verjovski de Almeida Mestrado
30/10/2019 Regulação pós-transcricional em Halobacterium salinarum NRC-1: caracterização do gene VNG_RS05855 Junier Marrero Gutierrez Tie Koide Doutorado
25/10/2019 GTACG: Um arcabouço computacional focado em genômica comparativa de bactérias de um mesmo ramo evolutivo Caio Rafael do Nascimento Santiago Luciano Antonio Digiampietri Doutorado
21/10/2019 Genômica comparativa aplicada no estudo da invasividade de Streptococcus pyogenes Suzane de Andrade Barboza Luciano Antonio Digiampietri Mestrado
27/09/2019 Genômica comparativa e filogenômica de <i>Xylella fastidiosa</i> Guillermo Uceda Campos Aline Maria da Silva Mestrado
04/09/2019 Análise comparativa do genoma de bacteriófagos isolados da compostagem e estudo dos determinantes de sua interação com Pseudomonas aeruginosa Fernando Pacheco Nobre Rossi Aline Maria da Silva Mestrado
22/08/2019 Análise  Estrutural de Sítios de Fosforilação em Proteína Juan Enrique Faya Castillo Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Mestrado
20/08/2019 Classificação Taxonômica de Sequências obtidas com Meta-ômicas por meio de Integração de Dados Felipe Prata Lima João Carlos Setubal Doutorado
09/08/2019 Herdabilidade e Estudo de Associação Genômica Ampla (GWAS) de Atividade Física Autorreportada - uma investigação de famílias brasileiras Jean Michel Rocha Sampaio Leite Julia Maria Pavan Soler Mestrado
05/08/2019 Análise transcritômica de amostras humanas naturalmente infectadas por Chikungunya Virus Natália Baptista Cruz Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
02/08/2019 Uma abordagem integrada para a construção e utilização de HMMs de perfil para análises genômicas e metagenômicas Liliane Santana Oliveira Kashiwabara Arthur Gruber Doutorado
12/07/2019 Análise transcritômica de macacos Rhesus durante infecção por Zika Vírus Mariana Araújo Pereira Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
10/07/2019 Rastreando arbovírus em ambientes silvestre e urbano Marielton dos Passos Cunha Paolo Marinho de Andrade Zanotto Doutorado Direto
02/07/2019 Mineração de dados de anemia falciforme e priapismo Mina Cintho Ozahata João Eduardo Ferreira Doutorado
04/06/2019 Papel do colágeno na síndrome congênita de Zika: uma abordagem de Biologia de Sistemas Fábio Baldívia Pohl Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
09/05/2019 Desenvolvimento de uma Ferramenta Computacional para Análise de Co-Expressão Gênica e sua Aplicação na Biologia de Sistemas Pedro de Sá Tavares Russo Helder Takashi Imoto Nakaya Doutorado Direto
08/05/2019 Análise da Tetramerização da Proteína CD38 por meio de Docking Molecular Jadson Carlos dos Santos Silvana Giuliatti Mestrado
27/03/2019 Ordenação evolutiva de genes Pedro Ivo Gomes de Faria João Carlos Setubal Doutorado Direto
27/02/2019 Identificação e anotação funcional de novos transcritos com expressão alterada no câncer pancreático Omar Julio Sosa Eduardo Moraes Rego Reis Doutorado Direto
22/02/2019 Construção e Aplicação de HMMs de Perfil para a Detecção e Classificação de Vírus Miriã Nunes Guimarães Arthur Gruber Mestrado
07/02/2019 Predição de função para TSSaRNAs (transcritos associados a sitios de início de transcrição) em<i> Halobacterium salinarum</i> NRC-1 Yagoub Ali Ibrahim Adam Arthur Gruber Doutorado Direto
13/12/2018 Usando Biologia de Sistemas para entender a Imunossenescência Fernando Marcon Passos Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
12/12/2018 Investigação de perfis microbianos humanos e sua relação com o câncer Andrew Maltez Thomas João Carlos Setubal Doutorado
10/12/2018 Incorporação de evidências biológicas para a identificação de SNPs interferindo em sítios alvos de miRNAs Paula Prieto Oliveira João Carlos Setubal Doutorado
26/09/2018 Transcriptoma, Sítios de Ligação para Fatores de Transcrição e Região Promotora de cana-de-açúcar Mauro de Medeiros Oliveira Glaucia Mendes Souza Doutorado
08/05/2018 Halobacterium salinarum NRC-1: Rede de Regulação Gênica e sua análise probabilística Guilherme Martins Crocetti Glaucia Mendes Souza Mestrado
03/05/2018 Genômica comparativa de tripanossomatídeos portadores de endossimbiontes e sua implicação no genoma de Angomonas ambiguus Anderson Carvalho Morais João Marcelo Pereira Alves Mestrado
10/04/2018 Genômica Comparada e a Evolução da Defesa Química em Anfíbios Denis Jacob Machado Taran Grant Doutorado
23/03/2018 Métodos de validação tradicional e temporal aplicados à avaliação de classificadores de RNAs codificantes e não codificantes Clebiano da Costa Sá Taran Grant Mestrado
15/03/2018 Redes Neurais Residuais Profundas e Autômatos Celulares como Modelos para Predição que Fornecem Informação Sobre a Formação de Estruturas Secundárias Proteicas. José Geraldo de Carvalho Pereira Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Doutorado
08/02/2018 BioNetStat: Uma ferramenta para análise diferencial de redes biológicas Vinícius Jardim Carvalho Marcos Silveira Buckeridge Mestrado
06/02/2018 Detecção de<i> Copy Number Variation (CNV)</i> e sua caracterização na população brasileira  Ana Cláudia Martins Ciconelle Julia Maria Pavan Soler Mestrado
14/12/2017 Systems Integration Tool: uma ferramenta para integração e visualização de dados em larga escala e sua aplicação em cana-de-açúcar Amanda Rusiska Piovezani Marcos Silveira Buckeridge Doutorado
27/11/2017 Análise Transcricional de RNAs Não Codificadores Longos em Pacientes com Dengue Matheus Carvalho Bürger Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
24/11/2017 Análise do transcritoma de Haemophilus influenzae tipo b durante o processo de fermentação em biorreator Carlos Eduardo Madureira Trufen Anatoli Iambartsev Mestrado
24/11/2017 Determinação pré-natal não invasiva de paternidade utilizando micro-haplótipos Jaqueline Yu Ting Wang Helder Takashi Imoto Nakaya Mestrado
22/11/2017 Arquitetura genética dos genes codificadores de proteínas ligantes de RNA Fernando Cipriano de Andrade Oliveira André Fujita Doutorado
30/10/2017 Análise do transcritoma do mexilhão marrom (Perna perna) sob contaminação por antraceno Jhonatas Sirino Monteiro João Carlos Setubal Mestrado
27/10/2017 Predição Computacional de Sítios de Ligação de Fatores de Transcrição Baseada em Gramáticas Regulares Estocásticas. Antonio Ferrão Neto João Carlos Setubal Mestrado
20/10/2017 Modelagem e implementação de banco de dados clínicos e moleculares de pacientes com câncer e seu uso para identificação de marcadores em câncer de pâncreas Ester Risério Matos Bertoldi Eduardo Moraes Rego Reis Mestrado
09/10/2017 Estruturas de Redes em Ossos ao longo do desenvolvimento Cynthia Martins Villar Couto Luciano da Fontoura Costa Doutorado
10/08/2017 O papel de Transferência Horizontal de Genes na história evolutiva de duas classes de genes em bactérias Luiz Thibério Lira Diniz Rangel João Carlos Setubal Doutorado
09/08/2017 "Uso de técnicas de reconhecimento de padrões e genetica para a predição de transtornos psiquiatricos da infância" Walkiria Karla Resende Helena Paula Brentani Mestrado
08/08/2017 Identificação e análise<i> in silico</i> de ncRNAs empregando dados de RNA-seq em Leishmania. Patrícia de Cássia Ruy Angela Kaysel Cruz Doutorado
04/08/2017 Alinhamento Múltiplo de Genomas de Eucariotos com Montagens Altamente Fragmentadas George Willian Condomitti Epamino João Carlos Setubal Mestrado
12/06/2017 Caravela: um navegador para metagenomas Gianluca Major Machado da Silva João Carlos Setubal Mestrado
02/06/2017 O transcritoma da retinopatia induzida por oxigênio e uma assinatura gênica prognóstica baseada em angiogênese para predição de recidiva de cancer de mama Rodrigo Guarischi Mattos Amaral de Sousa João Carlos Setubal Doutorado
17/04/2017 Um modelo Bayesiano de Meta-Análise para dados de Chip-Seq Pablo de Morais Andrade Carlos Alberto de Braganca Pereira Doutorado Direto
11/04/2017 LincRNAs fisicamente associados ao receptor de andrógeno modificam o perfil de marcas da cromatina vizinha e alteram a expressão gênica local Lucas Ferreira da Silva Sergio Verjovski de Almeida Doutorado
10/04/2017 COARSE-GRAINED MODELING OF THE PROTEIN COMPLEXATION PHENOMENA Sergio Alejandro Poveda Cuevas Fernando Luis Barroso da Silva Mestrado
21/02/2017 Análise de transcritomas de células de pacientes xeroderma pigmentosum após irradiação com luz UVA e estudo de retrocópias de genes de reparo Francisco Ivanio Arruda Alves Carlos Frederico Martins Menck Mestrado
15/02/2017 A transcrição pervasiva na archaea Halobacterium salinarum NRC-1 e a identificação de novos transcritos Felipe ten Caten Tie Koide Doutorado Direto
24/01/2017 Estudo por simulação computacional em larga escala da complexação de proteínas do leite   Lariani Aparecida Delboni Fernando Luis Barroso da Silva Mestrado
21/12/2016 Análise exploratória de genes compostos predominantemente por microexons arranjados em tandem em uma coleção de anotações de genomas  Bruno Ferreira de Souza Sergio Verjovski de Almeida Mestrado
09/12/2016 Análise computacional dos genomas de duas estirpes brasileiras de Bradyrhizobium de importância econômica Gesiele Almeida Barros de Carvalho Marie Anne van Sluys Doutorado
18/11/2016 Análise computacional da diversidade viral presente na comunidade microbiana do processo de compostagem do Zoológico de São Paulo Deyvid Emanuel Amgarten João Carlos Setubal Mestrado
17/11/2016 Análise do Metaboloma da Cana-de-Açúcar ao Longo do Ciclo de Maturação da Planta Davi Toshio Inada Glaucia Mendes Souza Mestrado
13/10/2016 Estudo comparativo de duas estratégias utilizadas na busca de relações funcionais entre genes Juan Manuel Vidal Garcia André Fujita Mestrado
06/10/2016 Origem de genes recentes, uma abordagem com PSSMs deterioradas e arquiteturas de domínio proteico Diego Trindade de Souza Sergio Russo Matioli Doutorado
12/08/2016 Suporte ao desenvolvimento e à composição de serviços web semânticos para a análise de expressão gênica Gabriela Der Agopian Guardia Clever Ricardo Guareis de Farias Doutorado Direto
08/08/2016 Uma Arquitetura de Question-Answering Instanciada no Domínio  de Doenças Crônicas Luciana Farina Almansa Alessandra Alaniz Macedo Mestrado
28/07/2016 Análise global da expressão de RNAs não codificadores no sistema imunológico humano na senescência e sepse Diogo Vieira da Silva Pellegrina Eduardo Moraes Rego Reis Mestrado
15/07/2016 Bioinformática aplicada à biologia sistêmica para a identificação dos fatores regulatórios do acúmulo de sacarose no colmo da cana-de-açúcar Fabrício Edgar de Moraes Carlos Alberto Labate Doutorado
25/05/2016 Desenvolvimento de um pipeline para anáise genômica de metilação do DNA Henrique Cursino Vieira Helena Paula Brentani Mestrado
02/05/2016 Integração de dados na inferência de redes de genes: avaliação de informações biológicas e características topológicas Fábio Fernandes da Rocha Vicente Fabricio Martins Lopes Doutorado
25/04/2016 Identificação <i>in silico </i>de ncRNAs no organismo modelo <i>Halobacterium salinarum</i> NRC-1 Marcos Abraão de Souza Fonseca Fabricio Martins Lopes Doutorado
25/04/2016 Caracterização de sítios conformacionais de fosforilação em proteínas Felipe Augusto Nunes Ferraz Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Mestrado
20/04/2016 Caracterização e modelagem da atividade eletrofisiológica em pacientes com epilepsia Abner Cardoso Rodrigues Neto Koichi Sameshima Doutorado
15/04/2016 Reconstrução da rede metabólica em escala genômica da bactéria Burkholderia sacchari Paulo Moisés Raduan Alexandrino André Fujita Mestrado
29/03/2016 Desenvolvimento de um modelo biofísico para a descrição do processo de reparo de quebra-dupla em DNA Aymara Martínez Aragón Joao Dias de Toledo Arruda Neto Doutorado Direto
18/03/2016 Processamento, extração de características e análise morfométrica automatizada de fibras mielínicas Rômulo Bourget Novas Joaquim Cezar Felipe Mestrado
11/12/2015 Ferramenta computacional para análise integrada de dados clínicos e biomoleculares Yuri Ferretti Joaquim Cezar Felipe Mestrado
03/12/2015 Implementação de abordagens computacionais para identificação de RNAs longos não codificadores envolvidos na diferenciação neural Gabriel Francisco Zaniboni Eduardo Moraes Rego Reis Mestrado
30/11/2015 Algoritmos evolutivos aplicados na investigação da adaptabilidade do código genético Lariza Laura de Oliveira Renato Tinós Doutorado
17/11/2015 Implementação de uma abordagem híbrida utilizando modelagem comparativa e<i> ab initio</i> para predição de estruturas tridimensionais de proteínas contendo múltiplos domínios com conectores flexíveis  Rodrigo Vargas Honorato Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Doutorado Direto
13/10/2015 Análise de componentes esparsos locais com aplicações em ressonância magnética funcional Gilson Vieira Luíz Antonio Baccala Doutorado
08/10/2015 Busca de variantes em sequência de DNA proveniente de pacientes com deficiência em processos de reparo do genoma Livia Maria Silva Moura Carlos Frederico Martins Menck Mestrado
06/10/2015 Caracterização da estrutura e dinâmica das redes funcionais neurais durante um processo de indução anestésica Eduardo Cocca Padovani André Fujita Mestrado
23/09/2015 Reconstrução e análise de genomas de bactérias de compostagem a partir de dados metagenômicos Leandro Nascimento Lemos João Carlos Setubal Mestrado
21/09/2015 Suporte ao desenvolvimento e à integração de ontologias no domínio biomédico Ricardo Cacheta Waldemarin Clever Ricardo Guareis de Farias Mestrado
02/09/2015 Exploração de espaços de parâmetros de modelos biológicos sob diferentes paradigmas estatisticos Andre Chalom Machado de Oliveira Paulo Inácio de Knegt López de Prado Mestrado
21/08/2015 Análise computacional da variação do potencial metabólico microbiano em metagenomas Deibs Barbosa João Carlos Setubal Doutorado
17/08/2015 Modelagem computacional de famílias de proteínas microbianas relevantes para produção de bioenergia Fernanda Orpinelli Ramos do Rego João Carlos Setubal Mestrado
22/07/2015 Uma abordagem integrativa usando dados de interação proteína-proteína e estudos genéticos para priorizar genes e funções biológicas em transtorno de déficit de atenção e hiperatividade Leandro de Araujo Lima Helena Paula Brentani Doutorado
30/06/2015 Uma abordagem de integração de dados de redes PPI e expressão gência para priorizar genes relacionados a doenças complexas Sérgio Nery Simões Helena Paula Brentani Doutorado Direto
13/04/2015 Desenvolvimento da plataforma CaneRegNet para anotação funcional e análises do transcriptoma da cana-de-açúcar Milton Yutaka Nishiyama Junior Glaucia Mendes Souza Doutorado Direto
04/02/2015 Utilização de informações termodinâmicas e estruturais na predição de sítios de ligação de receptores nucleares ao DNA: uma abordagem computacional Ana Claudia Mancusi Valeije Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Mestrado
05/12/2014 Caracterização de processos evolutivos de vírus de RNA a partir de padrões deixados nas filogenias virais Caio César de Melo Freire Paolo Marinho de Andrade Zanotto Doutorado Direto
01/12/2014 Análise gênica de comorbidades a partir da integração de dados epidemiológicos Karla Ferraz Néto Evandro Eduardo Seron Ruiz Mestrado
19/08/2014 Infraestrutura computacional para avaliação de similaridade funcional composta entre microRNAs baseada em ontologias Mariana Yuri Sasazaki Joaquim Cezar Felipe Mestrado
15/05/2014 Framework para classificação das mutações de vírus HIV Mina Cintho Ozahata João Eduardo Ferreira Mestrado
14/04/2014 Metodologia para integração de dados genômicos, transcriptômicos e epigenéticos de câncer de pênis Fabio Albuquerque Marchi Silvia Regina Rogatto Doutorado Direto
12/12/2013 Explorando a complexidade do transcriptoma humano José Eduardo Kroll Sandro José de Souza Doutorado
07/11/2013 Troost - Busca de interações entre trios de SNPs em estudos de associação de genoma inteiro José Osório de Oliveira Azevedo Neto Sergio Russo Matioli Doutorado Direto
25/10/2013 Sifter-T: Um framework escalável para anotação filogenômica probabilística funcional de domínios protéicos Danillo Cunha de Almeida e Silva Sergio Russo Matioli Mestrado
17/10/2013 Busca guiada de patentes de Bioinformática Marcio Branquinho Dutra Alessandra Alaniz Macedo Mestrado
24/09/2013 Um filtro iterativo utilizando árvores de decisão Oscar Picchi Netto José Augusto Baranauskas Mestrado
12/09/2013 SIMTar: uma ferramenta para predição de SNPs interferindo em sítios alvos de microRNAs Amanda Rusiska Piovezani José Augusto Baranauskas Mestrado
30/08/2013 Uma adaptação do método <i>Binary Relevance</i> utilizando árvores de decisão para problemas de classificação multirrótulo aplicado à genômica funcional Erica Akemi Tanaka José Augusto Baranauskas Mestrado
27/08/2013 Uma abordagem para a construção de uma única árvore a partir de uma <i>Random Forest</i> para classificação de bases de expressão gênica Thais Mayumi Oshiro José Augusto Baranauskas Mestrado
13/08/2013 Caracterização <i>in silico</i> e análise de expressão de RNAs não codificadores longos no genoma de eucariotos Vinicius Ramos Henriques Maracajá Coutinho Sergio Verjovski de Almeida Doutorado Direto
24/06/2013 Análise<i> in silico</i> de regiões promotoras de genes de <i>Xylella fastidiosa</i> Fernando Domingues Kümmel Tria Aline Maria da Silva Mestrado
17/06/2013 Método de apoio à pesquisa e ao diagnóstico clínico na identificação de acometimento em diferentes tipos de fibras musculares por meio de imagens histopatológicas Marlon Polo de Melo Joaquim Cezar Felipe Mestrado
06/02/2013 Genômica translacional: integrando dados clínicos e biomoleculares Newton Shydeo Brandão Miyoshi Joaquim Cezar Felipe Mestrado
25/10/2012 Estudo da poliadenilação alternativa: efeito dos polimorfismos nos elementos em <i>cis </i>no RNA e de transcritos em antissenso Suzana Andreoli Marques Ezquina Sandro José de Souza Doutorado Direto
17/10/2012 Dinâmica da fermentação alcóolica: aplicação de redes booleanas na dinâmica de expressão gênica em linhagens de <i>Saccharomyces Cerevisiae</i> durante o processo fermentativo Melline Fontes Noronha Sandro José de Souza Mestrado
05/10/2012 Inovações em técnicas de alinhamentos múltiplos e predições de genes Vitor Ferreira Onuchic Sandro José de Souza Mestrado
28/09/2012 Função de avaliação dinâmica em algoritmos genéticos aplicados na predição de estruturas tridimensionais de proteínas Luís Henrique Uchida Ishivatari Renato Tinós Mestrado
17/07/2012 Auto-organização da população em sistemas imunológicos artificiais aplicada ao <i>docking</i> de proteínas Helder Ken Shimo Renato Tinós Mestrado
29/05/2012 Método para auxiliar a interpretação de clusters de expressão gênica considerando sumarização automática Daniane Silva de Paula Alessandra Alaniz Macedo Mestrado
23/05/2012 Descrição da proveniência de dados para extração de conhecimento em sistemas de informação de hemoterapia Fernanda Nascimento Almeida Ester Cerdeira Sabino Doutorado
18/04/2012 Uma abordagem para a indução de árvores de decisão voltada para dados de expressão gênica Pedro Santoro Perez José Augusto Baranauskas Mestrado
13/04/2012 Bioinformática aplicada em RNomics: estratégias computacionais para caracterização de RNAs não-codificadores Alexandre Rossi Paschoal José Augusto Baranauskas Doutorado
13/04/2012 Uso de mapeamento conceitual para redução da descontinuidade semântica na recuperação de imagens microscópicas de carcinoma tireoidiano Hugo César Pessotti Alessandra Alaniz Macedo Mestrado
02/04/2012 Análise computacional do genoma e transcritoma de <i>Plasmodium vivax</i>: contribuições da bioinformática para o estudo da malária Bruna Renata Silva Corrêa Alessandra Alaniz Macedo Mestrado
06/03/2012 Representação paramétrica de famílias de redes booleanas que produzem ondas de propagação Ubiratan Augusto Lima Junior Barrera Mestrado
15/12/2011 Uma abordagem baseada em ontologias e conectores para a integração semântica de ferramentas de análise de expressão gênica Flavia Akemi Miyazaki Clever Ricardo Guareis de Farias Mestrado
28/11/2011 Auxílio na prevenção de doenças crônicas por meio de mapeamento e relacionamento conceitual de informações em biomedicina Juliana Tarossi Pollettini Alessandra Alaniz Macedo Mestrado
24/11/2011 Método para processamento e análise computacional de imagens histopatológicas visando apoiar o diagnóstico de câncer de colo de útero Gisele Helena Barboni Miranda Joaquim Cezar Felipe Mestrado
08/07/2011 Modelagem matemática-computacional da conectividade cerebral em ressonância magnética funcional para o estudo do estado de repouso Gilson Vieira Luíz Antonio Baccala Mestrado
25/05/2011 Desenvolvimento de um algoritmo para identificação e caracterização de cavidades em regiões específicas de estruturas tridimensionais de proteínas Saulo Henrique Pires de Oliveira Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Mestrado
20/05/2011 Uso de estratégias baseadas em conhecimento para algoritmos genéticos aplicados à predição de estruturas tridimensionais de proteínas Lariza Laura de Oliveira Renato Tinós Mestrado
20/04/2011 Canalização: fenótipos robustos como consequência de características da rede de regulação gênica Vitor Hugo Louzada Patricio Renato Tinós Mestrado
21/02/2011 Redes complexas de expressão gênica: síntese, identificação, análise e aplicações Vitor Hugo Louzada Patricio Roberto Marcondes Cesar Junior Doutorado
03/11/2010 Seleção natural no vírus da hepatite C: influência do sistema imune na resposta ao tratamento Artur Trancoso Lopo de Queiroz Sergio Russo Matioli Doutorado Direto
29/07/2010 Medidas de dependência entre séries temporais: estudo comparativo, análise estatística e aplicações em neurociências Carlos Stein Naves de Brito Koichi Sameshima Mestrado
16/04/2010 Aplicação de métodos estatísticos e computacionais para o estudo da cis-regulação da expressão gênica Marcio Augusto Afonso de Almeida Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Doutorado Direto
11/02/2010 Identificação de transferência gênica horizontal em procariotos, estudo do regulon SOS de <i>Caulobacter crescentus</i> e análise estatística de colocalização de posições genômicas Apuã César de Miranda Paquola Carlos Frederico Martins Menck Doutorado Direto
01/12/2009 Abordagem algébrica para seleção de clones ótimos em projetos genomas e metagenomas Mauricio Egidio Cantão Eliana Gertrudes Macedo Lemos Doutorado Direto
12/05/2009 Planejamento, gerenciamento e análise de dados de microarranjos de DNA para identificação de biomarcadores de diagnóstico e prognóstico de cânceres humanos Ana Carolina Quirino Simões Aline Maria da Silva Doutorado Direto
06/05/2009 Técnicas para análise do crescimento e movimento das células neurais Leandro Carrijo Cintra Luciano da Fontoura Costa Doutorado Direto
15/01/2009 Medidas de fluxo de informação com aplicação em neurociência Daniel Yasumasa Takahashi Koichi Sameshima Doutorado Direto
11/12/2008 Análise da via de regulação gênica por ácido retinóico: uma abordagem por bioinformática e biologia estrutural Tiago José Paschoal Sobreira Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Doutorado Direto
02/12/2008 Identificação<i> in-silico </i>de genes humanos submetidos à expressão alélica diferencial Jorge Estefano Santana de Souza Sandro José de Souza Doutorado Direto
25/09/2008 Morfometria computacional de frangos de corte submetidos a duas dietas distintas: suplementação mineral quelada versus suplementação mineral tradicional Rafael Carvalho de Oliveira Marcelo Emílio Beletti Doutorado Direto
03/09/2008 Métodos estatísticos para a análise de bibliotecas digitais de expressão gênica Leonardo Varuzza Carlos Alberto de Braganca Pereira Doutorado Direto
13/05/2008 Sistema colaborativo para armazenamento e análise de dados de HIV Luciano Vieira de Araújo João Eduardo Ferreira Doutorado
25/04/2008 Modelos discretos para sistemas de sinalização celular baseados no contato célula-célula Luiz Carlos da Silva Rozante João Eduardo Ferreira Doutorado
14/04/2008 Representação de sistemas biológicos a partir de sistemas dinâmicos: controle da transcrição a partir do estrógeno Marcelo Ris Junior Barrera Doutorado
14/02/2008 Análise computacional da expressão gênica no parasita protostomado Schistosoma mansoni. Thiago Motta Venancio Sergio Verjovski de Almeida Doutorado
20/12/2007 Métodos computacionais para a caracterização e análise da relação entre anatomia e expressão gênica em sistemas biológicos. Bruno Augusto Nassif Travençolo Luciano da Fontoura Costa Doutorado Direto
10/12/2007 Bioinformática estrutural de proteínas modificadas por eventos de splicing alternativo Elza Helena Andrade Barbosa Durham Sandro José de Souza Doutorado
03/10/2007 "Seleção de modelos através de um teste de hipótese genuinamente Bayesiano: misturas de normais multivariadas e hipóteses separadas" Elza Helena Andrade Barbosa Durham Julio Michael Stern Doutorado
10/08/2007 "Análise de dados de expressão gênica: normalização de microarrays e modelagem de redes regulatórias" Elza Helena Andrade Barbosa Durham Carlos Eduardo Ferreira Doutorado Direto
27/06/2007 Modelagem do controle gênico do ciclo celular por redes genéticas probabilísticas Nestor Walter Trepode Junior Barrera Doutorado
30/05/2007 "Fatores moleculares da determinação do sexo e casta e evolução de famílias multigênicas na abelha eusocial Apis mellifera" Alexandre dos Santos Cristino Zila Luz Paulino Simoes Doutorado
16/05/2007 Implicações funcionais de eventos de splicing alternativo no proteoma humano Fabio Passetti Paulo Sérgio Lopes de Oliveira Doutorado
23/03/2007 Métodos estatísticos para a análise de dados de cDNA microarray em um ambiente computacional integrado Gustavo Henrique Esteves Eduardo Jordao Neves Doutorado
19/01/2007 Cadeias estocásticas parcimoniosas com aplicações à classificação e filogenia das seqüências de proteínas Gustavo Henrique Esteves Jefferson Antonio Galves Doutorado Direto
16/01/2007 Análise e reconhecimento digital de formas biológicas para o diagnóstico automático de parasitas do gênero Eimeria Cesar Armando Beltran Castañon Arthur Gruber Doutorado
20/12/2006 Predição de RNAs não codificantes e sua aplicação na busca do componente RNA da telomerase Ariane Machado Lima Arthur Gruber Doutorado
09/11/2006 Um novo modelo para cálculo de probabilidade de paternidade - concepção e implementação Fábio Nakano Carlos Alberto de Braganca Pereira Doutorado
01/09/2006 Análise estatística na interpretação de imagens: microarranjos de DNA e ressonância magnética funcional Ricardo Zorzetto Nicoliello Vencio Carlos Alberto de Braganca Pereira Doutorado